Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec10Q8CF98 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms