Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF31

Uncharacterized protein C11orf94 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF31 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CF31 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CF31 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CF31 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CF31 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CF31 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CF31 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CF31 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CF31 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CF31 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CF31 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CF31 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CF31 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CF31 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF31 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms