Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E4f1Q8CCE9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E4f1Q8CCE9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms