Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip1Q8CBD1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms