Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhsl1Q8CAF4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms