Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vwc2Q8C8N3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vwc2Q8C8N3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vwc2Q8C8N3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vwc2Q8C8N3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vwc2Q8C8N3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vwc2Q8C8N3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vwc2Q8C8N3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vwc2Q8C8N3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vwc2Q8C8N3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vwc2Q8C8N3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vwc2Q8C8N3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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