Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa5Q8C7G5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa5Q8C7G5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms