Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrbnQ8C7D2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrbnQ8C7D2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms