Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms