Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FarsaQ8C0C7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FarsaQ8C0C7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FarsaQ8C0C7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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FarsaQ8C0C7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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FarsaQ8C0C7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms