Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms