Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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