Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp40Q8BWR4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp40Q8BWR4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms