Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx17Q8BVL3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx17Q8BVL3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms