Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcl3Q8BVF2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms