Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms