Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms