Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms