Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms