Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933430I17RikQ8BHW4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933430I17RikQ8BHW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms