Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3bQ8BHK2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms