Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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