Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms