Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms