Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl42Q8BFQ9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl42Q8BFQ9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms