Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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