Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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