Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn34b3Q80ZS5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn34b3Q80ZS5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms