Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pkhd1l1Q80ZA4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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