Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms