Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5bQ80Y84 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5bQ80Y84 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5bQ80Y84 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5bQ80Y84 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5bQ80Y84 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5bQ80Y84 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5bQ80Y84 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5bQ80Y84 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms