Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acsm4Q80W40 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsm4Q80W40 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsm4Q80W40 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsm4Q80W40 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsm4Q80W40 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsm4Q80W40 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsm4Q80W40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms