Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL3

Prickle3, Prickle planar cell polarity protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle3Q80VL3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prickle3Q80VL3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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