Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcmf1Q80UY2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms