Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2eQ80UW8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms