Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3cQ80U95 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms