Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms