Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Arhgef17Q80U35 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Arhgef17Q80U35 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Arhgef17Q80U35 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Arhgef17Q80U35 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Arhgef17Q80U35 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Arhgef17Q80U35 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Arhgef17Q80U35 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms