Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcdh8Q7TSK3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms