Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms