Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms