Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms