Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx4Q7TNK1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms