Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmc8Q7TN58 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms