Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms