Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne2Q6ZWQ0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne2Q6ZWQ0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms