Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RfflQ6ZQM0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms