Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms