Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms