Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd4Q6ZPR5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms